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Nico Ortlieb

Nico hat seine Arbeit am 01.07.2019 erfolgreich verteidigt.

Nico Ortlieb

Nico Ortlieb

Arbeitsgruppe Biogene Arzneistoffe
Institut für Pharmazie
Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg

Auf der Morgenstelle 28
D-72076 Tübingen

Tel. +49 7071 29 74624

Wissenschaftliche Arbeit

Promotionsthema:

Isolierung, biologische Charakterisierung und Biosynthese von Quorum-Sensing-beeinflussenden und antibakteriellen Naturstoffen aus Actinomyceten

In meiner Arbeit beschäftige ich mich mit der Identifizierung und Charakterisierung von (neuen), antiinfektiven Naturstoffen aus Actinomyceten. Dabei beschränkt sich die Suche nicht nur auf antibakterielle Substanzen, sondern erstreckt sich auch auf Stoffe, die die Virulenz pathogener Keime wie z.B. S. aureus hemmen.
Mithilfe eines eigens dafür entwickelten Screeningsystems konnten innerhalb der Tübinger Stammsammlung einige interessante Stämme identifiziert werden. Im weiteren Verlauf optimiere ich die Produktions-, sowie anschließend die Extraktionsbedingungen für die jeweiligen Stämme. Die Isolierung der aktiven Substanzen erfolgt dann bioaktivitätsgeleitet mithilfe verschiedenster chromatografischer Methoden (MPLC; HPLC) und die finale Strukturaufklärung unter Zuhilfenahme diverser analytischer Techniken (HRMS, NMR, VCD-Spektroskopie, Polarimetrie, etc.).

Poster:

  • HIPS Symposium 2016: Actinobacteria - a source for antivirulence leads?
  • JNPC 2016: Screening of actinobacteria for inhibition of quorum sensing of Chromobacterium violaceum CV026 and Staphylococcus aureus PC322
  • VAAM Workshop 2016: Actinobacteria and cyanobacteria as sources for quorum sensing inhibitors
  • MiCom 2017: Screening of actinobacteria for new antivirulence leads against Chromobacterium violaceum CV026 and Staphylococcus aureus PC322

Publikationen:

  • Ortlieb, N., Klenk, E., Kulik, A., Niedermeyer, T.H.J. 2021. Development of an agar-plug cultivation system for bioactivity assays of actinomycete strain collections. PLOS ONE, accepted.
  • Kirchner, N., Cano-Prieto, C., Schulz-Fincke, A., Gütschow, M, Ortlieb, N., Moschny, J., Niedermeyer, T.H.J.,  Horak, J., Lämmerhofer, M, Van der Voort, M, Raaijmakers, J. , Gross,  H. 2021. Discovery of Thanafactin A, a Linear Proline-Containing  Octa-Lipopeptide from Pseudomonas sp. SH-C52, Motivated by Genome  Mining. J Nat Prod, 84: 101–109   .
  • Ortlieb, N., Bretzel, K., Kulik, A., Haas, J., Lüdeke, S., Keilhofer, N., Schrey, S. D., Gross, H., Niedermeyer, T.H.J. 2018. Xanthocidin derivatives from the endophytic Streptomyces sp. AcE210 provide insight into the xanthocidin biosynthesis. ChemBioChem, 19:2472-2480.    
  • Ortlieb, N., Keilhofer, N., Schrey, S.D., Gross, H., Niedermeyer, T.H.J. 2018. Draft Genome Sequence of the Xanthocidin-Producing Strain Streptomyces sp. AcE210, isolated from a root nodule of Alnus glutinosa (L.). Microbiol Resour Announc, 7:e01190-18.   
  • Buchmann, A., Cano-Prieto, C., Nafis, A., Barakate, M., Baz, M., Hassani, L., Ortlieb, N., Niedermeyer, T.H.J., Gross, H. 2018. Draft Genome Sequence of the Novonestmycin-Producing Strain Streptomyces sp. Z26, isolated from potato rhizosphere in Morocco. Microbiol Ressour Announc, 8:e01514-    18.    

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